sangerseqR

DOI:10.18129 / B9.bioc.sangerseqR

工具在R Sanger测序数据

Bioconductor版本:版本(3.15)

这个包包含几个工具分析R Sanger测序数据文件,包括阅读.scf和.ab1文件,使basecalls和图绘制色谱图。

作者:乔纳森·t·希尔,布拉德利Demarest

乔纳森·希尔在byu.edu < jhill维护者:>

从内部引用(R,回车引用(“sangerseqR”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“sangerseqR”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“sangerseqR”)

PDF R脚本 sangerseqR
PDF 参考手册

细节

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版本 1.32.0
Bioconductor自 BioC 2.14 (r - 3.1)(8.5年)
许可证 GPL-2
取决于 R (> = 3.0.2),Biostrings
进口 方法,闪亮的
链接
建议 BiocStyle,knitr,RUnit,BiocGenerics
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我 sangeranalyseR
进口我
建议我 CrispRVariants
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 sangerseqR_1.32.0.tar.gz
Windows二进制 sangerseqR_1.32.0.zip(64位)
macOS 10.13(高山脉) sangerseqR_1.32.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/sangerseqR
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ sangerseqR
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/sangerseqR/
包下载报告 下载数据

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  • 支持网站——关于Bioconductor包的问题
  • 正常词 开发人员邮件列表,包bob电竞体育官网