安全的

doi:10.18129/b9.bioc.safe

功能和表达的显着性分析

生物导体版本:版本(3.15)

SAFE是一种基于重采样的方法,用于测试基因表达实验中的功能类别。安全可以应用于2样本和多类比较或简单的线性回归。其他实验设计也可以通过用户定义的功能来适应。

作者:威廉·T·巴里(William T. Barry)

维护者:hms.harvard.edu>的路德维格·盖斯林格

引用(从r内,输入引用(“安全”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)Biocmanager :: install(“ SAFE”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“安全”)

PDF R脚本 安全手册
PDF 参考手册

细节

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版本 3.36.0
在生物导体中 Bioc 1.6(R-2.1)或更早(> 17年)
执照 GPL(> = 2)
要看 r(> = 2.4.0),AnnotationDbi,,,,生物酶, 方法,Sparsem
进口
链接
建议 go.db,,,,pfam.db,,,,Reactome.db,,,,HGU133A.DB,,,,乳腺癌,,,,生存,,,,foreach,,,,Dorng,,,,rgraphviz,,,,gostats
系统要求
增强
URL
取决于我 PCGSE
进口我 Egsea,,,,富集兄弟
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 Safe_3.36.0.tar.gz
Windows二进制 safe_3.36.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) SAFE_3.36.0.TGZ
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/safe
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:包装/安全
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/safe/
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