sSNAPPY

DOI:10.18129 / B9.bioc.sSNAPPY

单样本定向路径扰动分析

Bioconductor版本:版本(3.17)

单个样本通道扰动RNA-seq数据的测试方法。方法将基因表达变化的基因簇拓扑计算single-sample定向路径扰动分数反映的潜在方向变化。微扰分数可用于测试的意义途径扰动individual-sample和治疗水平。

作者:蒙牛刘(aut (cre)Stephen Pederson (aut)

维护人员:蒙牛刘<蒙牛。刘在adelaide.edu.au >

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如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“sSNAPPY”)

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细节

biocViews	bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载
版本	1.4.1
Bioconductor自	BioC 3.15 (r - 4.2)(1年)
许可证	GPL-3
取决于	R (> = 4.2.0), ggplot2
进口	dplyr (> = 1.1), magrittr rlang,统计数据,BiocParallel,石墨,宠物猫Rcpp ggraph、igraph reshape2,org.Hs.eg.db,SummarizedExperiment,刨边机、方法、ggforce pheatmap跑龙套,stringr
链接	Rcpp, RcppArmadillo
建议	BiocManager,BiocStylecowplot, DT, htmltools knitr,老鸨,rmarkdown,拼写,testthat (> = 3.0.0), tidyverse
SystemRequirements	c++ 11
增强了
URL	https://wenjun-liu.github.io/sSNAPPY/
BugReports	https://github.com/Wenjun-Liu/sSNAPPY/issues
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包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	sSNAPPY_1.4.1.tar.gz
Windows二进制	sSNAPPY_1.4.1.zip
macOS二进制(x86_64)	sSNAPPY_1.4.1.tgz
macOS二进制(arm64)	sSNAPPY_1.4.1.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/sSNAPPY
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ sSNAPPY
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/sSNAPPY/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/sSNAPPY/
包下载报告	下载数据
老BioC 3.17源码包	源存档