rrvgo

DOI:10.18129 / B9.bioc.rrvgo

Reduce +可视化GO

生物导体版本:发布(3.12)

通过基于语义相似度的冗余度识别，减少和可视化基因本体术语列表。

作者:Sergi Sayols [aut, cre]

维护者:Sergi Sayols

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!安装BiocManager::install("rrvgo")

有关较旧版本的R，请参阅适当的Bioconductor释放。

文档

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browseVignettes(“rrvgo”)

超文本标记语言	R脚本	使用rrvgo
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细节

biocViews	bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载
版本	1.2.0
Bioconductor自	BioC 3.11 (R-4.0)(1年)
许可证	GPL-3
取决于
进口	GOSemSim,AnnotationDbi,GO.db,pheatmap,ggplot2,ggrepel,treemap,tm,wordcloud,闪亮的， grDevices, grid, stats, methods
链接
建议	knitr,rmarkdown,BiocStyle,testthat(> =魅惑,shinydashboard,DT,情节,的热图,magrittr跑龙套,clusterProfiler,剂量,大满贯,org.Ag.eg.db,org.At.tair.db,org.Bt.eg.db,org.Ce.eg.db,org.Cf.eg.db,org.Dm.eg.db,org.Dr.eg.db,org.EcK12.eg.db,org.EcSakai.eg.db,org.Gg.eg.db,org.Hs.eg.db,org.Mm.eg.db,org.Mmu.eg.db,org.Pf.plasmo.db,org.Pt.eg.db,org.Rn.eg.db,org.Sc.sgd.db,org.Ss.eg.db,org.Xl.eg.db
SystemRequirements
增强了
URL	//www.anjoumacpherson.com/packages/rrvgohttps://ssayols.github.io/rrvgo/index.html
取决于我
进口我
建议我
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

源包	rrvgo_1.2.0.tar.gz
Windows二进制	rrvgo_1.2.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	rrvgo_1.2.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/rrvgo
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ rrvgo
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/rrvgo/
包下载报告	下载数据