RGSEPD
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doi：10.18129/b9.bioc.rgsepd
基因集富集 /投影显示
生物导体版本：版本（3.15）
R/GSEPD是R/gsepd，用于R/gsepd通过自动化差分表达式（使用DESEQ2），然后是基因集富集（带有Goseq），最后是N二维，用于帮助消除歧义的RIDAMINAL tongiation转录组样品（RNA-Seq计数的矩阵（RNA-Seq计数的矩阵））。投影以量化每个样品都像任何一种治疗组一样。
作者：卡尔·斯塔姆（Karl Stamm）
维护者：karl stamm
引用（从r内，输入引用（“ rgsepd”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：
if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）Biocmanager :: install（“ RGSEPD”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
browsevignettes（“ rgsepd”）
| R脚本 | RGSEPD软件包简介 | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 读书我 | |
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 |
| 版本 | 1.28.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.1（R-3.2）（7。5年） |
| 执照 | GPL-3 |
| 要看 | r（> = 4.2.0），deseq2，，，，Goseq（> = 1.28） |
| 进口 | GPLOTS，，，，Biomart，，，，org.hs.eg.db，，，，go.db，，，，总结性特征，，，，AnnotationDbi |
| 链接 | |
| 建议 | 引导， 工具，生物基因，，，，尼特，，，，Xtable |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | rgsepd_1.28.0.tar.gz |
| Windows二进制 | RGSEPD_1.28.0.ZIP |
| MacOS 10.13（高山脉） | RGSEPD_1.28.0.TGZ |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/rgsepd |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/rgsepd |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/rgsepd/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
