rfarm.

DOI:10.18129 / b9.bioc.rfarm.

RFAM数据库的R接口

Biocometiond版本:释放(3.12)

RFARM向RNA系列RFAM数据库提供客户端界面。可以检索的数据包括RNA家族,次要结构图像,协方差模型,每个家庭内的序列,导通以点支架格式识别家庭和二次结构的对准。

作者:Lara卖Vidal,Rafael Ayala,Guy-Bart Stan,Rodrigo Ledesma-Amaro

维护者:Lara在Imperial.Ac.uk>,Rafael Ayala

引文(从R内,输入引文(“RFARM”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.0”)并输入:

if(!percennamespace(“biocmanager”,squilly = true))install.packages(“biocmanager”)biocmanager ::安装(“rfarm”)

对于旧版本,请参阅相应的生物导体释放

文件

要查看系统中安装此包版本的文档,请启动r并输入:

BROWSEVIGNETTES(“RFARM”)

HTML. r script. rfarm.
PDF. 参考手册
文本 消息

细节

Biocviews. bob 体育平台下载 bob 体育平台下载 bob 体育平台下载 bob 体育平台下载 bob 体育平台下载 bob 体育平台下载
版本 1.2.1
在生物导体中以来 BIOC 3.11(R-4.0)(1年)
执照 GPL-3.
依靠
进口 Httr.stringi.rsvg.魔法data.table.生物仪器,实用,XML2.绞喉S4Vectors.
链接到
建议 R4RNA树木kn生物焦RAMAMAMDOW.生物根系
系统要求
加强
URL.
取决于我
进口我
建议我
链接给我
建立报告

包档案包

跟随bob 体育网址 在r会话中使用此包的说明。

源包 rfarm_1.2.1.tar.gz.
Windows二进制文件 rfarm_1.2.1.zip.
Macos 10.13(高塞拉) rfarm_1.2.1.tgz.
源存储库 git clone https://git.biocumon.org/packages/rfarm.
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.biocondion.org:包/ rfarm
包短网址 https://biocumon.org/packages/rfarm/
包裹下载报告 下载统计信息
BIOC 3.12的旧源包 源档案

文件»

生物体

R./cr包裹和文件

支持»

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