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regsplice
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DOI:10.18129 / B9.bioc.regsplice
L1-regularization基于微分检测拼接的方法
Bioconductor版本:版本(3.16)
统计方法检测微分拼接(微分外显子用法)RNA-seq和外显子微阵列数据,使用L1-regularization(套索)来提高能力。
作者:卢卡斯·m·韦伯(aut (cre)
维护人员:卢卡斯·m·韦伯在gmail.com < lukas.weber.edu >
从内部引用(R,回车引用(“regsplice”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“regsplice”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“regsplice”)
| HTML | R脚本 | regsplice工作流 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 | |
| 文本 | 许可证 |
细节
| biocViews | bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 |
| 版本 | 1.24.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.4 (r - 3.3)(6.5年) |
| 许可证 | 麻省理工学院+文件许可证 |
| 取决于 | |
| 进口 | glmnet,SummarizedExperiment,S4Vectors,limma,刨边机统计数据,pbapply、跑龙套、方法 |
| 链接 | |
| 建议 | testthat,BiocStyle,knitr,rmarkdown |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | https://github.com/lmweber/regsplice |
| BugReports | https://github.com/lmweber/regsplice/issues |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | regsplice_1.24.0.tar.gz |
| Windows二进制 | regsplice_1.24.0.zip |
| macOS二进制(x86_64) | regsplice_1.24.0.tgz |
| macOS二进制(arm64) | regsplice_1.24.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/regsplice |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ regsplice |
| Bioc包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/regsplice/ |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/regsplice/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
