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recount3
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DOI:10.18129 / B9.bioc.recount3
从叙述t3项目中探索和下载数据
Bioconductor版本:Release (3.15)
该程序包可以访问大量经过统一处理的人类和小鼠RNA-seq数据。您可以下载rangedsummarizeexperimental对象在基因，外显子或外显子-外显子连接水平的样本元数据和QC统计数据。此外，我们还提供了访问BigWig覆盖示例文件的权限。
作者:Leonardo Collado-Torres [aut, cre]
维护者:Leonardo Collado-Torres
引文(从R内，输入引用(“recount3”))：
安装
要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:
如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．
文档
要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:
browseVignettes(“recount3”)
| 超文本标记语言 | R脚本 | 叙述3快速入门指南 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 |
| 版本 | 1.6.0 |
| 在Bioconductor | BioC 3.12 (R-4.0)(1.5年) |
| 许可证 | 艺术- 2.0 |
| 取决于 | SummarizedExperiment |
| 进口 | BiocFileCache、方法、rtracklayer，S4Vectors跑龙套,RCurl，data.table，R.utils，矩阵，GenomicRanges，sessioninfo、工具 |
| 链接 | |
| 建议 | BiocStyle，covr，knitcitations，knitr，RefManageR，rmarkdown，testthat，pryr，interactiveDisplayBase，重新计票 |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | https://github.com/LieberInstitute/recount3 |
| BugReports | https://github.com/LieberInstitute/recount3/issues |
| 全靠我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | RNAseqQC |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
| 源包 | recount3_1.6.0.tar.gz |
| Windows二进制 | recount3_1.6.0.zip |
| macOS 10.13 (High Sierra) | recount3_1.6.0.tgz |
| 源库 | Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/recount3 |
| 源存储库(开发人员访问) | Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/ recret3 |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/recount3/ |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |
