receptLoss

DOI:10.18129 / B9.bioc.receptLoss

无监督识别子集的肿瘤基因表达的损失

Bioconductor版本:版本(3.17)

receptLoss识别基因的表达式是迷失在子集相对于正常组织的肿瘤。它特别适合在这种情况下,正常组织样本的数量很小,基因表达在正常组织样本的分布是由高斯近似。最初设计用于识别核激素受体表达损失也可以转录组应用广泛。

作者:约翰•Greally丹尼尔·皮克杰西卡Mar

维护人员:丹尼尔皮克<丹尼尔。皮克在med.einstein.yu.edu >

安装

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如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“receptLoss”)

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HTML	R脚本	receptLoss
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细节

biocViews	bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载
版本	1.12.0
Bioconductor自	BioC 3.11 (r - 4.0)(3年)
许可证	GPL-3 +文件许可证
取决于	R (> = 3.6.0)
进口	dplyr、ggplot2 magrittr tidyr,SummarizedExperiment
链接
建议	knitr、rmarkdown testthat(> =魅惑,这里
SystemRequirements
增强了
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包档案

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源包	receptLoss_1.12.0.tar.gz
Windows二进制	receptLoss_1.12.0.zip
macOS二进制(x86_64)	receptLoss_1.12.0.tgz
macOS二进制(arm64)	receptLoss_1.12.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/receptLoss
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ receptLoss
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/receptLoss/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/receptLoss/
包下载报告	下载数据