生物导体版本:版本(3.15)
NCI-60癌细胞系面板已在数十年中用作抗癌药物筛查。该小组是美国国家癌症研究所(NCI)的开发治疗计划(DTP,http://dtp.nci.nih.gov/)的一部分。已经在NCI-60上测试了数千种化合物,这些化合物的特征是许多用于基因和蛋白质表达,拷贝数,突变等的平台(Reinhold等,2012)。CellMiner项目(http://discover.nci.nih.gov/cellminer)的目的是整合来自用于分析NCI-60的多个平台的数据,并为NCI-60的探索提供了强大的工具数据。
作者:Augustin Luna,Vinodh Rajapakse,Fabricio Sousa
维护人员:Augustin Luna
引用(从r内,输入引用(“ rcellminer”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:
if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)Biocmanager :: install(“ rcellminer”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“ Rcellminer”)
html | R脚本 | 使用rcellminer |
参考手册 | ||
文本 | 消息 | |
文本 | 执照 |
生物浏览 | bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 |
版本 | 2.18.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.1(R-3.2)(7年) |
执照 | LGPL-3 +文件执照 |
要看 | r(> = 3.2),生物酶,,,,rcellminerdata(> = 2.0.0) |
进口 | Stringr,,,,GPLOTS,,,,GGPLOT2,方法,统计,utils,闪亮的 |
链接 | |
建议 | 尼特,,,,rcolorbrewer,,,,SQLDF,,,,生物基因,,,,测试,,,,生物使用,,,,jsonlite,,,,热图,,,,Glmnet,,,,foreach,,,,Dosnow, 平行,rmarkDown |
系统要求 | |
增强 | |
URL | http://discover.nci.nih.gov/cellminer/ |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | rcellminerdata |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | rcellminer_2.18.0.tar.gz |
Windows二进制 | rcellminer_2.18.0.zip |
MacOS 10.13(高山脉) | rcellminer_2.18.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/rcellminer |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/rcellminer |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/rcellminer/ |
软件包下载报告 | 下载统计 |