rcellminer

doi:10.18129/b9.bioc.rcellminer

rcellminer:NCI-60细胞系的分子曲线,药物反应和化学结构

生物导体版本:版本(3.15)

NCI-60癌细胞系面板已在数十年中用作抗癌药物筛查。该小组是美国国家癌症研究所(NCI)的开发治疗计划(DTP,http://dtp.nci.nih.gov/)的一部分。已经在NCI-60上测试了数千种化合物,这些化合物的特征是许多用于基因和蛋白质表达,拷贝数,突变等的平台(Reinhold等,2012)。CellMiner项目(http://discover.nci.nih.gov/cellminer)的目的是整合来自用于分析NCI-60的多个平台的数据,并为NCI-60的探索提供了强大的工具数据。

作者:Augustin Luna,Vinodh Rajapakse,Fabricio Sousa

维护人员:Augustin Luna ,vinodh rajapakse ,fathi elloumi >

引用(从r内,输入引用(“ rcellminer”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)Biocmanager :: install(“ rcellminer”)

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文档

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版本 2.18.0
在生物导体中 Bioc 3.1(R-3.2)(7年)
执照 LGPL-3 +文件执照
要看 r(> = 3.2),生物酶,,,,rcellminerdata(> = 2.0.0)
进口 Stringr,,,,GPLOTS,,,,GGPLOT2,方法,统计,utils,闪亮的
链接
建议 尼特,,,,rcolorbrewer,,,,SQLDF,,,,生物基因,,,,测试,,,,生物使用,,,,jsonlite,,,,热图,,,,Glmnet,,,,foreach,,,,Dosnow, 平行,rmarkDown
系统要求
增强
URL http://discover.nci.nih.gov/cellminer/
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建议我 rcellminerdata
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源包 rcellminer_2.18.0.tar.gz
Windows二进制 rcellminer_2.18.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) rcellminer_2.18.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/rcellminer
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/rcellminer
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/rcellminer/
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