rWikiPathways

DOI:10.18129 / B9.bioc.rWikiPathways

rWikiPathways - R WikiPathways API客户端库

Bioconductor版本:版本(3.16)

使用这个包与WikiPathways API接口。它提供了编程访问WikiPathways内容在多个数据和图像格式,包括月度发布官方文件和格林尼治时间方便读/写功能。

作者:大多Willighagen (aut (cre),亚历克斯Pico (aut)

维护人员:大多Willighagen <大多。在gmail.com willighagen >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“rWikiPathways”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“rWikiPathways”)

HTML	R脚本	1。概述
HTML	R脚本	2。rWikiPathways和BridgeDbR
HTML	R脚本	3所示。rWikiPathways和RCy3
HTML	R脚本	4所示。路径分析
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载
版本	1.18.0
Bioconductor自	BioC 3.7 (r - 3.5)(4.5年)
许可证	麻省理工学院+文件许可证
取决于
进口	httr跑龙套,XML,rjson,data.table,tidyr,RCurl
链接
建议	testthat,BiocStyle,knitr,rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/wikipathways/rwikipathways
BugReports	https://github.com/wikipathways/rwikipathways/issues
取决于我
进口我	famat,multiSight,NoRCE,TimiRGeN
建议我	TRONCO
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	rWikiPathways_1.18.0.tar.gz
Windows二进制	rWikiPathways_1.18.0.zip
macOS二进制(x86_64)	rWikiPathways_1.18.0.tgz
macOS二进制(arm64)	rWikiPathways_1.18.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/rWikiPathways
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ rWikiPathways
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/rWikiPathways/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/rWikiPathways/
包下载报告	下载数据