rBiopaxParser

DOI:10.18129 / B9.bioc.rBiopaxParser

解析BioPax文件并用R表示

Bioconductor版本:Release (3.15)

解析BioPAX文件并用R表示,目前支持BioPAX级别2和级别3。

作者:弗兰克·克莱默

维护者:Frank Kramer < Frank . Kramer at informatik. ini -augsburg.de>

引文(从R内,输入引用(“rBiopaxParser”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“rBiopaxParser”)

PDF R脚本 rBiopaxParser装饰图案
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

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版本 2.36.0
在Bioconductor BioC 2.12 (R-3.0)(9.5年)
许可证 GPL (>= 2)
取决于 R (>= 4.0),data.table
进口 XML
链接
建议 RgraphvizRCurlRUnitBiocGenericsRBGLigraph
SystemRequirements
增强了
URL https://github.com/frankkramer-lab/rBiopaxParser
全靠我
进口我 pwOmics
建议我 AnnotationHubNetPathMiner
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 rBiopaxParser_2.36.0.tar.gz
Windows二进制 rBiopaxParser_2.36.0.zip(64位)
macOS 10.13 (High Sierra) rBiopaxParser_2.36.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/rBiopaxParser
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/rBiopaxParser
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/rBiopaxParser/
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