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- Bioconductor 3.16
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qsvaR
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DOI:10.18129 / B9.bioc.qsvaR
为降解生成质量替代变量分析修正
Bioconductor版本:版本(3.16)
qsvaR包包含函数删除degration rna-seq数据的影响从死亡的脑组织。包装备来帮助用户生成主成分与降解有关。差异表达分析中使用的组件可以消除降解的影响。
作者:约书亚Stolz (aut (cre)
列奥纳多·达·芬奇Collado-Torres(施)
维护人员:约书亚Stolz <乔希。在libd.org stolz >
从内部引用(R,回车引用(“qsvaR”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“qsvaR”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“qsvaR”)
| HTML | R脚本 | 介绍qsvaR |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 |
| 版本 | 1.2.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.15 (r - 4.2)(0.5年) |
| 许可证 | 艺术- 2.0 |
| 取决于 | R (> = 4.2),SummarizedExperiment |
| 进口 | 股东价值分析统计数据,ggplot2、方法 |
| 链接 | |
| 建议 | BiocFileCache,BiocStyle,covr,knitr,limma,RefManageR,rmarkdown,sessioninfo,testthat(> = 3.0.0) |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | https://github.com/LieberInstitute/qsvaR |
| BugReports | https://support.bioconductor.org/t/qsvaR |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | qsvaR_1.2.0.tar.gz |
| Windows二进制 | qsvaR_1.2.0.zip |
| macOS二进制(x86_64) | qsvaR_1.2.0.tgz |
| macOS二进制(arm64) | qsvaR_1.2.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/qsvaR |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ qsvaR |
| Bioc包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/qsvaR/ |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/qsvaR/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
