QRQC

doi:10.18129/b9.bioc.qrqc

快速阅读质量控制

生物导体版本:版本(3.15)

快速扫描读取并收集有关基础和质量频率,读取长度,k-mers的统计信息,以及频繁的序列。产生用于质量控制管道中的统计数据的图形输出,并提供可选的HTML质量报告。S4序列对象允许围绕收集的数据编写特定的测试和功能。

作者:文斯·布法罗

维护者:ucdavis.edu>的文斯·布法罗

引用(从r内,输入引用(“ QRQC”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)Biocmanager :: install(“ QRQC”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ QRQC”)

PDF R脚本 使用QRQC软件包收集有关序列质量的信息
PDF 参考手册
文本 消息

细节

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版本 1.50.0
在生物导体中 Bioc 2.8(R-2.13)(11年)
执照 GPL(> = 2)
要看 重塑,,,,GGPLOT2,,,,生物弦,,,,Biovizbase,,,,酿造,,,,Xtable,,,,测试
进口 重塑,,,,GGPLOT2,,,,生物弦,,,,Biovizbase,图形,方法,plyr,统计
链接 Rhtslib(> = 1.15.3)
建议
系统要求 gnu做
增强
URL http://github.com/vsbuffalo/qrqc
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 QRQC_1.50.0.tar.gz
Windows二进制 qrqc_1.50.0.0.zip(仅64位)
MacOS 10.13(高山脉) QRQC_1.50.0.0.TGZ
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/qrqc
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/qrqc
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/qrqc/
软件包下载报告 下载统计

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