生物导体版本:版本(3.15)
快速扫描读取并收集有关基础和质量频率,读取长度,k-mers的统计信息,以及频繁的序列。产生用于质量控制管道中的统计数据的图形输出,并提供可选的HTML质量报告。S4序列对象允许围绕收集的数据编写特定的测试和功能。
作者:文斯·布法罗
维护者:ucdavis.edu>的文斯·布法罗
引用(从r内,输入引用(“ QRQC”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:
if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)Biocmanager :: install(“ QRQC”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
browsevignettes(“ QRQC”)
R脚本 | 使用QRQC软件包收集有关序列质量的信息 | |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 |
版本 | 1.50.0 |
在生物导体中 | Bioc 2.8(R-2.13)(11年) |
执照 | GPL(> = 2) |
要看 | 重塑,,,,GGPLOT2,,,,生物弦,,,,Biovizbase,,,,酿造,,,,Xtable,,,,测试 |
进口 | 重塑,,,,GGPLOT2,,,,生物弦,,,,Biovizbase,图形,方法,plyr,统计 |
链接 | Rhtslib(> = 1.15.3) |
建议 | |
系统要求 | gnu做 |
增强 | |
URL | http://github.com/vsbuffalo/qrqc |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | QRQC_1.50.0.tar.gz |
Windows二进制 | qrqc_1.50.0.0.zip(仅64位) |
MacOS 10.13(高山脉) | QRQC_1.50.0.0.TGZ |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/qrqc |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/qrqc |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/qrqc/ |
软件包下载报告 | 下载统计 |