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qpgraph
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DOI:10.18129 / B9.bioc.qpgraph
从高通量基因组数据估计遗传和分子调控网络
Bioconductor版本:Release (3.15)
从高通量表达和基因分型分析估计基因和eQTL网络。
作者:Robert Castelo [aut, cre]， Alberto Roverato [aut]
维护者:Robert Castelo < Robert。Castelo在upf.edu>
引文(从R内，输入引用(“qpgraph”))：
安装
要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:
如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．
文档
要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:
browseVignettes(“qpgraph”)
| BasicUsersGuide.pdf | ||
| R脚本 | 使用qpgraph估计eQTL网络 | |
| R脚本 | 利用qpgraph对转录调控网络进行逆向工程 | |
| R脚本 | 利用qpgraph模拟分子调控网络 | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
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| 版本 | 2.30.0 |
| 在Bioconductor | BioC 2.4 (R-2.9)(13年) |
| 许可证 | GPL (>= 2) |
| 取决于 | R (>= 3.5) |
| 进口 | 方法、并行矩阵(>= 1.0)，网格，注释，图(> = 1.45.1),Biobase，S4Vectors，BiocParallel，AnnotationDbi，IRanges，GenomeInfoDb，GenomicRanges，GenomicFeatures，mvtnorm，qtl，Rgraphviz |
| 链接 | |
| 建议 | RUnit，BiocGenerics，BiocStyle，genefilter，org.EcK12.eg.db，rlecuyer，雪，类别，GOstats |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | https://github.com/rcastelo/qpgraph |
| BugReports | https://github.com/rcastelo/rcastelo/issues |
| 全靠我 | |
| 进口我 | 限幅器 |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
| 源包 | qpgraph_2.30.0.tar.gz |
| Windows二进制 | qpgraph_2.30.0.zip |
| macOS 10.13 (High Sierra) | qpgraph_2.30.0.tgz |
| 源库 | Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/qpgraph |
| 源存储库(开发人员访问) | Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/qpgraph |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/qpgraph/ |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |
