QCKITFASTQ

doi:10.18129/b9.bioc.qckitfastq

FastQ质量控制

生物导体版本:版本(3.15)

评估具有多个指标的FASTQ文件格式,包括质量得分,序列内容,代表性过高和kmers。

作者:Wenyue Xing [AUT],August Guang [AUT,CRE]

维护者:august guang

引用(从r内,输入引用(“ qckitfastq”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)Biocmanager :: install(“ qckitfastq”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ qckitfastq”)

PDF R脚本 质量控制分析和使用QCKITFASTQ可视化
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载
版本 1.12.0
在生物导体中 Bioc 3.9(R-3.6)(3年)
执照 艺术2.0
要看
进口 马格里特,,,,GGPLOT2,,,,dplyr,,,,seqtools,,,,Zlibbioc,,,,Data.Table,,,,RESHAPE2,grdevices,图形,统计,utils,RCPP,,,,rlang,,,,RSEQAN
链接 RCPP,,,,RSEQAN
建议 尼特,,,,rmarkDown,,,,KableExtra,,,,测试
系统要求 gnu做
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 qckitfastq_1.12.0.tar.gz
Windows二进制 qckitfastq_1.12.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) qckitfastq_1.12.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/qckitfastq
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/qckitfastq
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/qckitfastq/
软件包下载报告 下载统计

文档»

生物导体

r/克兰软件包和文档

支持»

请阅读发布指南。向以下位置之一发布有关生物导体的问题:

  • 支持网站- 有关生物处理套件的问题
  • 正常词 邮件列表 - 包装开发人员bob电竞体育官网