生物导体版本:版本(3.15)
评估具有多个指标的FASTQ文件格式,包括质量得分,序列内容,代表性过高和kmers。
作者:Wenyue Xing [AUT],August Guang [AUT,CRE]
维护者:august guang
引用(从r内,输入引用(“ qckitfastq”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:
if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)Biocmanager :: install(“ qckitfastq”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
browsevignettes(“ qckitfastq”)
R脚本 | 质量控制分析和使用QCKITFASTQ可视化 | |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 |
版本 | 1.12.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.9(R-3.6)(3年) |
执照 | 艺术2.0 |
要看 | |
进口 | 马格里特,,,,GGPLOT2,,,,dplyr,,,,seqtools,,,,Zlibbioc,,,,Data.Table,,,,RESHAPE2,grdevices,图形,统计,utils,RCPP,,,,rlang,,,,RSEQAN |
链接 | RCPP,,,,RSEQAN |
建议 | 尼特,,,,rmarkDown,,,,KableExtra,,,,测试 |
系统要求 | gnu做 |
增强 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | qckitfastq_1.12.0.tar.gz |
Windows二进制 | qckitfastq_1.12.0.zip |
MacOS 10.13(高山脉) | qckitfastq_1.12.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/qckitfastq |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/qckitfastq |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/qckitfastq/ |
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