杂种

doi:10.18129/b9.bioc.pwomics

基于途径的数据集成OMIC数据

生物导体版本:版本(3.15)

PWOMICS基于基于差异基因/转录本和磷蛋白的预先分析的用户指定列表的匹配的OMIC数据集进行基于途径的水平数据比较。对包括途径鉴定,转录因子鉴定和靶基因鉴定在内的磷酸蛋白质组学数据的单独分析与从基因或转录信息开始的上游分析相反,作为鉴定上游转录因子和潜在蛋白质组学调节剂的基础。跨平台比较分析允许通过提供静态和动态分析工具进行数据集成来全面分析单个时间点实验和时间序列实验。此外,它提供了基于数据集成的单个信号轴的功能。

作者:Astrid Wachter

维护者:Maren Sitte

引用(从r内,输入引用(“ pwomics”)):

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if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)Biocmanager :: install(“ PWOMICS”)

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在生物导体中 Bioc 3.1(R-3.2)(7年)
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