PVCA

doi:10.18129/b9.bioc.pvca

主方差分析(PVCA)

生物导体版本:版本(3.15)

该软件包包含通过将所有“源”拟合为随机效果来评估批处理源的功能,包括混合模型中的双向交互项(取决于LME4软件包)与所选的主组件,这些效果是从原始数据相关矩阵中获得的。该包伴随着“微阵列体验中的批处理效果和噪音,第12章。

作者:Pierre Bushel

维护者:jianying li

引用(从r内,输入引用(“ PVCA”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ pvca”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ PVCA”)

PDF R脚本 微阵列数据中的批次效果估计
PDF 参考手册

细节

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版本 1.36.0
在生物导体中 Bioc 2.12(R-3.0)(9。5年)
执照 LGPL(> = 2.0)
要看 R(> = 2.15.1)
进口 矩阵,,,,生物酶,,,,VSN,统计LME4
链接
建议 golubeset
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我 表达式正式工作流,,,,概率
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 pvca_1.36.0.tar.gz
Windows二进制 pvca_1.36.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) pvca_1.36.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/pvca
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/pvca
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/pvca/
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