pulsedSilac

DOI:10.18129 / B9.bioc.pulsedSilac

pulsed-SILAC定量蛋白质组学数据的分析

Bioconductor版本:版本(3.16)

这个包提供了一些工具,用于pulsed-SILAC数据分析。功能是提供组织数据,计算同位素比值,同位素分数,模型蛋白质周转,营业额比较模型,估计细胞生长和估计同位素回收。做一些可视化工具还包括基本数据探索,质量控制,条件比较,单个模型检验和模型的比较。

作者:马克•Pages-Gallego Tobias Dansen

维护人员:马克Pages-Gallego < M。在umcutrecht.nl PagesGallego >

从内部引用(R,回车引用(“pulsedSilac”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“pulsedSilac”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

PDF 参考手册

细节

biocViews bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载
版本 1.12.0
Bioconductor自 BioC 3.10 (r - 3.6)(3年)
许可证 GPL-3
取决于 R (> = 3.6.0)
进口 robustbase、方法、R.utilstaRifx,S4Vectors,SummarizedExperiment,ggplot2,ggridges,统计,跑龙套,UpSetR,cowplot、网格MuMIn
链接
建议 testthat(> =魅惑,knitr,rmarkdown,gridExtra
SystemRequirements
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包
Windows二进制
macOS二进制(x86_64)
macOS二进制(arm64)
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/pulsedSilac
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ pulsedSilac
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/pulsedSilac/
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