后代
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DOI:10.18129 / B9.bioc.progeny
从基因表达推断活性的通路响应基因
Bioconductor版本:Release (3.15)
PROGENy是一种资源，它利用了大量公开可用的信号扰动实验，以产生人类和小鼠通路响应基因的共同核心。这些，加上任何统计方法，可以用来推断通路活动从批量或单细胞转录组。
作者:Michael Schubert [aut]， Alberto Valdeolivas [ctb]
——克里斯蒂安·h·霍兰德[ctb]，伊戈尔·布拉诺夫[ctb]， Aurélien杜古尔德[cre, ctb]
维护者:Aurélien Dugourd
引文(从R内，输入引用(“后代”))：
安装
要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:
如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．
文档
要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:
browseVignettes(“后代”)
| 超文本标记语言 | R脚本 | PROGENy通路特征 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 | |
| 文本 | 许可证 |
细节
| biocViews | bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 |
| 版本 | 1.18.0 |
| 在Bioconductor | BioC 3.6 (R-3.4)(4.5年) |
| 许可证 | Apache License(== 2.0) |文件许可证 |
| 取决于 | R (>= 3.6.0) |
| 进口 | Biobase统计数据,dplyr，tidyr，ggplot2，ggrepel，gridExtra，解耦，reshape2 |
| 链接 | |
| 建议 | 气道，biomaRt，BiocFileCache，扫帚，修拉，SingleCellExperiment，DESeq2，BiocStyle，knitr，readr，readxl，pheatmap，宠物猫，rmarkdown，testthat(> = 2.1.0的) |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | https://github.com/saezlab/progeny |
| BugReports | https://github.com/saezlab/progeny/issues |
| 全靠我 | |
| 进口我 | 更容易 |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
| 源包 | progeny_1.18.0.tar.gz |
| Windows二进制 | progeny_1.18.0.zip |
| macOS 10.13 (High Sierra) | progeny_1.18.0.tgz |
| 源库 | Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/progeny |
| 源存储库(开发人员访问) | Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/子代 |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/progeny/ |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |
