profileplyr
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doi：10.18129/b9.bioc.profileplyr
基因组范围内的读取信号的可视化和注释与profileplyr
生物导体版本：版本（3.13）
基因组间隔上读取信号的快速而直接的可视化是从测序数据集生成假设的关键（例如chip-seq，atac-seq，bisulfite/bisulfite/甲基seq）。R内部和外部的许多工具都可以探索这些类型的数据，它们通常从大翅膀或BAM文件开始，并以信号的某些表示（例如热图）结束。profileplyr利用许多生物导体工具允许在工作流程中以读取信号的可视化结束的工作流程中的灵活性和其他功能。
作者：汤姆·卡罗尔（Tom Carroll）和道格·巴罗斯（Doug Barrows）
维护者：tom carroll
引用（从r内，输入引用（“ profileplyr”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.1”）并输入：
if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ profileplyr”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
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browsevignettes（“ profileplyr”）
| html | R脚本 | 基因组范围内的读取信号的可视化和注释与profileplyr |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 |
| 版本 | 1.8.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.9（R-3.6）（2年） |
| 执照 | GPL（> = 3） |
| 要看 | r（> = 3.6），生物基因，，，，总结性特征 |
| 进口 | 基因组机，统计soggi，方法，utils，S4VECTORS，，，，r.utils，，，，dplyr，，，，马格里特，，，，花花公子，，，，iranges，，，，rjson，，，，Chipseeker，，，，GenomicFeatures，，，，txdb.hsapiens.ucsc.hg19，，，，txdb.hsapiens.ucsc.hg38.nown，，，，txdb.mmusculus.ucsc.mm10.nowngene，，，，txdb.mmusculus.ucsc.mm9，，，，org.hs.eg.db，，，，org.mm.eg.db，，，，rgreat，，，，pheatmap，，，，GGPLOT2，，，，富集图，，，，复杂的图像， 网格，循环，，，，生物比较，，，，rtracklayer，，，，GenomeInfodB，grdevices，rlang，，，，开罗，，，，tiff |
| 链接 | |
| 建议 | 生物使用，，，，测试，，，，尼特，，，，rmarkDown，，，，PNG，，，，rsamtools |
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包装档案
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| 源包 | profileplyr_1.8.0.tar.gz |
| Windows二进制 | profileplyr_1.8.0.zip |
| MacOS 10.13（高山脉） | profileplyr_1.8.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/profileplyr |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/profileplyr |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/profileplyr/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
