proBAMr

DOI:10.18129 / B9.bioc.proBAMr

在鸟枪蛋白质组数据中为psm生成SAM文件

Bioconductor版本:发行版(3.13)

将psm映射回基因组。该包还提供了从GTF文件中准备注释的功能。

作者:王晓静

维护者:王小菁<小菁。Wang在vanderbilt。edu>

引文(从R内,输入引用(“proBAMr”)):

安装

要安装此包,请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("proBAMr")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“proBAMr”)

PDF R脚本 proBAMr简介
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews bob 体育平台下载 bob 体育平台下载 bob 体育平台下载 bob 体育平台下载 bob 体育平台下载
版本 1.26.0
在Bioconductor BioC 3.0 (R-3.1)(6.5年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 R (>= 3.0.1),IRangesAnnotationDbi
进口 GenomicRangesBiostringsGenomicFeaturesrtracklayer
链接
建议 RUnitBiocGenerics
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 proBAMr_1.26.0.tar.gz
Windows二进制 proBAMr_1.26.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra) proBAMr_1.26.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/proBAMr
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/proBAMr
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/proBAMr/
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