Primirtss
 |
 |
 |
 |
 |
 |
 |
doi：10.18129/b9.bioc.primirtss
PRI-MIRNA转录起始站点的预测
生物导体版本：版本（3.15）
一种快速，方便的工具，可以通过整合H3K4me3和Pol II的数据以及结合命令行和图形接口中提供的保护级别和序列功能来识别miRNA的TSSS，并结合了比以前的非非先前的非性能的功能。- miRNA TSSS上的细胞特异性方法。
作者：Pumin li [aut，cre]，Qi Xu [aut]，Jie Li [aut]，Jin Wang [aut]
维护者：pumin li
引用（从r内，输入引用（“ Primirts”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：
if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）Biocmanager :: install（“ Primirtss”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
Browsevignettes（“ Primirts”）
| html | R脚本 | Primirtss |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 |
| 版本 | 1.14.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.8（R-3.5）（3.5岁） |
| 执照 | GPL-2 |
| 要看 | R（> = 3.5.0） |
| 进口 | 基因组机（> = 1.32.2），S4VECTORS（> = 0.18.2），rtracklayer（> = 1.40.3），dplyr（> = 0.7.6），Stringr（> = 1.3.1），花花公子（> = 0.8.1），生物弦（> = 2.48.0），purrr（> = 0.2.5），bsgenome.hsapiens.ucsc.hg38（> = 1.4.1），phastcons100way.ucsc.hg38（> = 3.7.1），GenomicsCores（> = 1.4.1），闪亮的（> = 1.0.5），GVIZ（> = 1.24.0），生物基因（> = 0.26.0），iranges（> = 2.14.10），TFBSTOOLS（> = 1.18.0），Jaspar2018（> = 1.1.1），蒂布尔（> = 1.4.2），r.utils（> = 2.6.0），统计，utils |
| 链接 | |
| 建议 | 尼特，，，，rmarkDown |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | https://github.com/ipumin/primirtss |
| BugReports | http://github.com/ipumin/primirtss/issues |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | Primirts_1.14.0.tar.gz |
| Windows二进制 | Primirts_1.14.0.zip |
| MacOS 10.13（高山脉） | Primirts_1.14.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/primirtss |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：包装/primirtss |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/primirtss/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
