钢琴

doi:10.18129/b9.bioc.piano

综合分析OMIC数据的平台

生物导体版本:版本(3.15)

钢琴使用各种统计方法,来自不同的基因水平统计和广泛的基因组集合进行基因集分析。此外,钢琴包包含用于组合多个基因集分析结果的功能。

作者:gmail.com上的leif Varemo Wigge <钢琴<钢琴rpkg和intawat nookaew

维护者:leif Varemo Wigge <钢琴。rpkgat gmail.com>

引用(从r内,输入引用(“钢琴”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)Biocmanager :: install(“钢琴”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“钢琴”)

PDF R脚本 钢琴 - OMIC数据集成分析平台
html R脚本 与钢琴一起运行Gene-Set Anaysis
PDF 参考手册
文本 消息

细节

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版本 2.12.0
在生物导体中 Bioc 2.12(R-3.0)(9。5年)
执照 GPL(> = 2)
要看 R(> = 3.5)
进口 生物基因,,,,生物酶,,,,GPLOTS,,,,Igraph,,,,关系,,,,Marray,,,,fgsea,,,,闪亮的,,,,DT,,,,htmlwidgets,,,,Shinyjs,,,,发光的dashboard,,,,Visnetwork,,,,,grdevices,图形,统计,utils,方法
链接
建议 酵母2.DB,,,,RSBML,,,,plotrix,,,,林玛,,,,副词,,,,钳子,,,,affyplm,,,,gtools,,,,Biomart,,,,降雪,,,,AnnotationDbi,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,生物使用
系统要求
增强
URL http://www.sysbio.se/piano
BugReports https://github.com/varemo/piano/issues
取决于我
进口我 coregx,,,,pdatk
建议我 BloodCancermultiomics2017,,,,Cosmosr
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 钢琴_2.12.0.tar.gz
Windows二进制 钢琴_2.12.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) 钢琴_2.12.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/piano
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:包装/钢琴
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/piano/
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