Bioconductor版本:发行版(3.13)
PhenoPath在异质遗传和环境背景的存在下推断基因组轨迹(伪时间),并测试它们之间的相互作用。
作者:基兰·坎贝尔
维护者:Kieran Campbell
引文(从R内,输入引用(“phenopath”)
):
要安装此包,请启动R(版本“4.1”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("phenopath")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“phenopath”)
超文本标记语言 | R脚本 | 装饰图案的标题 |
参考手册 |
biocViews | bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 |
版本 | 1.16.0 |
在Bioconductor | BioC 3.6 (R-3.4)(3.5年) |
许可证 | Apache许可证(== 2.0) |
取决于 | |
进口 | Rcpp(> = 0.12.8),SummarizedExperiment,方法,统计,dplyr,宠物猫,ggplot2,tidyr |
链接 | Rcpp |
建议 | knitr,rmarkdown,forcats,testthat,BiocStyle,SingleCellExperiment |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | 飞溅 |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | phenopath_1.16.0.tar.gz |
Windows二进制 | phenopath_1.16.0.zip |
macOS 10.13 (High Sierra) | phenopath_1.16.0.tgz |
源库 | Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/phenopath |
源存储库(开发人员访问) | Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/phenopath |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/phenopath/ |
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