phenoTest

DOI:10.18129 / B9.bioc.phenoTest

工具来测试基因表达和表型之间的联系的方式高效、结构化、快速和可伸缩的。我们还提供了工具来做GSEA(基因集富集分析)和拷贝数变异。

Bioconductor版本:版本(3.15)

工具来测试基因表达之间的相关性和表型的方式高效、结构化、快速和可伸缩的。GSEA也提供。

作者:Evarist星球

维护人员:< Evarist Evarist行星。行星epfl.ch >

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安装

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如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“phenoTest”)

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细节

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版本 1.44.0
Bioconductor自 BioC 2.8 (r - 2.13)(11.5年)
许可证 GPL (> = 2)
取决于 R (> = 3.6.0),Biobase、方法、注释,Heatplus,BMA,ggplot2,Hmisc
进口 生存,limma,gplots,类别,AnnotationDbi,hopach,biomaRt,GSEABase,genefilter,xtable,注释,mgcv,hgu133a.db,椭圆
链接
建议 GSEABase,GO.db
SystemRequirements
增强了 平行,org.Ce.eg.db,org.Mm.eg.db,org.Rn.eg.db,org.Hs.eg.db,org.Dm.eg.db
URL
取决于我
进口我 癌症
建议我
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包档案

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源包 phenoTest_1.44.0.tar.gz
Windows二进制 phenoTest_1.44.0.zip
macOS 10.13(高山脉) phenoTest_1.44.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/phenoTest
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ phenoTest
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/phenoTest/
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