峰板

doi:10.18129/b9.bioc.phepanther

高分辨率实验的峰值接和注释

生物导体版本:版本(3.15)

用于在大量质谱数据文件中检测,集成和报告预定义特征的自动管道。它可以实现单个文件中多种化合物的实时注释,或在多个文件中的多个化合物的并行注释。图形用户界面以及命令行函数将有助于评估注释的质量和更新拟合参数,直到获得令人满意的结果为止。

作者:Arnaud Wolfer [AUT,CRE],Goncalo Correia [aut],Jake Pearce [CTB],Caroline Sands [CTB]

维护者:Arnaud Wolfer >

引用(从r内,输入引用(“峰板”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)Biocmanager :: install(“ Peakpanther”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ Peakpanther”)

html R脚本 开始使用Peakpanther软件包
html R脚本 平行注释
html R脚本 PeakPanther图形用户界面
html R脚本 实时注释
PDF 参考手册
文本 消息

细节

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版本 1.10.0
在生物导体中 Bioc 3.10(R-3.6)(2。5年)
执照 GPL-3
要看 R(> = 4.2)
进口 foreach(> = 1.4.4),多帕尔(> = 1.0.11),GGPLOT2(> = 3.3.0),栅格(> = 2.3),MSNBase(> = 2.4.0),MZR(> = 2.12.0),Stringr(> = 1.2.0),方法(> = 3.4.0),XML(> = 3.98.1.10),minpack.lm(> = 1.2.1),(> = 0.5.0),闪亮的(> = 1.0.5),BSLIB,,,,Shinycsssloaders(> = 1.0.0),DT(> = 0.15),pracma(> = 2.2.3),UTILS
链接
建议 测试,,,,DevTools,,,,法阿科,,,,MSDATA,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,潘德,,,,生物使用
系统要求
增强
URL https://github.com/phenomecentre/peakpanther
BugReports https://github.com/phenomecentre/peakpanther/issues/new
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 PeakPanther_1.10.0.tar.gz
Windows二进制 PeakPanther_1.10.0.zip(仅64位)
MacOS 10.13(高山脉) PeakPanther_1.10.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/peakpanther
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:包装/Peakpanther
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/peakpanther/
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