PCXN
 |
 |
 |
 |
 |
 |
 |
doi：10.18129/b9.bioc.pcxn
利用PCXNDATA软件包探索，分析和可视化功能
生物导体版本：版本（3.15）
发现单个途径/基因集的相关途径/基因集或发现多个途径/基因集之间的相关关系。绘制热图或创建查询网络，并提取可用集合中发现的每个途径/基因集的成员（MSIGDB H Hallmark，MSIGDB C2 C2 canonical Pathways，MSIGDB C5 GO BP和Pathprint）。
作者：Sokratis Kariotis，Yered Pita-Juarez，Winston Hide，Wenbin Wei
维护者：sokratis kariotis
引用（从r内，输入引用（“ PCXN”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：
if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ pcxn”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
Browsevignettes（“ PCXN”）
| R脚本 | PCXN | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 | |
| 文本 | 执照 |
细节
| 生物浏览 | bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 |
| 版本 | 2.18.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.6（R-3.4）（5年） |
| 执照 | 麻省理工学院 +文件执照 |
| 要看 | r（> = 3.4），pcxndata |
| 进口 | 方法，grdevices，utils，pheatmap |
| 链接 | |
| 建议 | Igraph，，，，注释，，，，org.hs.eg.db |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | pcxndata |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | pcxn_2.18.0.tar.gz |
| Windows二进制 | pcxn_2.18.0.zip |
| MacOS 10.13（高山脉） | pcxn_2.18.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/pcxn |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/pcxn |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/pcxn/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
