pcamethods

doi：10.18129/b9.bioc.pcamethods

PCA方法的集合

生物导体版本：版本（3.15）

提供贝叶斯PCA，概率PCA，NIPALS PCA，逆非线性PCA和常规SVD PCA。包括基于群集的基于群集的方法进行比较。BPCA，PPCA和NIPALSPCA可用于在不完整的数据上执行PCA，以及准确的缺少价值估计。还提供了一组用于打印和绘制结果的方法。所有PCA方法均使用相同的数据结构（PCARES）为PCA结果提供了共同的接口。在德国戈尔姆的Max-Planck分子植物生理学研究所发起。

作者：Wolfram Stacklies，Henning Redestig，Kevin Wright

维护者：Henning Redestig

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）Biocmanager :: install（“ pcamethods”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

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browsevignettes（“ pcamethods”）

PDF	R脚本	与异常值数据
PDF	R脚本	介绍
PDF	R脚本	缺少价值插补
PDF		参考手册

细节

生物浏览	bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载
版本	1.88.0
在生物导体中	Bioc 1.9（R-2.4）（15。5年）
执照	GPL（> = 3）
要看	生物酶， 方法
进口	生物基因，，，，RCPP（> = 0.11.3），大量的
链接	RCPP
建议	矩阵，，，，格子，，，，GGPLOT2
系统要求	RCPP
增强
URL	https://github.com/hredestig/pcamethods
BugReports	https://github.com/hredestig/pcamethods/issues
取决于我	deconrnaseq
进口我	自治，，，，共识，，，，达帕尔，，，，命运，，，，弗雷泽，，，，麦，，，，Matrixqcvis，，，，MSNBase，，，，MSPREP，，，，Multibac，，，，校长，，，，phosr，，，，PMP，，，，SCDE，，，，躯体签名
建议我	mscoreutils，，，，mtbls2，，，，qfeatures，，，，QMTools
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	pcamethods_1.88.0.tar.gz
Windows二进制	pcamethods_1.88.0.zip
MacOS 10.13（高山脉）	pcamethods_1.88.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/pcamethods
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/pcamethods
包装短URL	//www.anjoumacpherson.com/packages/pcamethods/
软件包下载报告	下载统计