PCAEXPLORER
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doi：10.18129/b9.bioc.pcaexplorer
使用主要组件方法对RNA-SEQ数据进行交互式可视化
生物导体版本：版本（3.13）
该软件包提供了基于主组件分析的RNA-Seq数据集的交互式可视化功能。提供的方法可以快速提取信息和有效的数据探索。闪亮的应用程序封装了整个分析。
作者：费德里科·马里尼（Federico Marini）[AUT，CRE]
维护者：uni-mainz.de>的Federico Marini
引用（从r内，输入引用（“ pcaexplorer”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.1”）并输入：
if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ pcaexplorer”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
browsevignettes（“ pcaexplorer”）
| html | R脚本 | PCAExplorer用户指南 |
| html | R脚本 | 使用PCAExplorer启动并运行 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 | |
| 文本 | 执照 |
细节
| 生物浏览 | bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 |
| 版本 | 2.18.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.3（R-3.3）（5年） |
| 执照 | 麻省理工学院 +文件执照 |
| 要看 | |
| 进口 | deseq2，，，，总结性特征，，，，基因组机，，，，iranges，，，，S4VECTORS，，，，GeneFilter，，，，GGPLOT2（> = 2.0.0），热图，，，，情节，，，，秤，，，，NMF，，，，plyr，，，，topgo，，，，林玛，，，，gostats，，，，go.db，，，，AnnotationDbi，，，，闪亮的（> = 0.12.0），发光的dashboard，，，，丝绸，，，，Ggrepel，，，，DT，，，，闪亮，，，，三j，，，，Biomart，，，，pheatmap，，，，尼特，，，，rmarkDown，，，，base64enc，，，，花花公子，grdevices，方法 |
| 链接 | |
| 建议 | 测试，，，，生物使用，，，，呼吸道，，，，org.hs.eg.db，，，，htmltools |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | https://github.com/federicomarini/pcaexplorerhttps://federicomarini.github.io/pcaexplorer/ |
| BugReports | https://github.com/federicomarini/pcaexplorer/issues |
| 取决于我 | |
| 进口我 | 理想的 |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | pcaexplorer_2.18.0.tar.gz |
| Windows二进制 | pcaexplorer_2.18.0.zip |
| MacOS 10.13（高山脉） | pcaexplorer_2.18.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/pcaexplorer |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/pcaexplorer |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/pcaexplorer/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
