生物导体版本:版本(3.15)
算法和用于硅包装型转座子的工具。过滤一个给定的DNA转座子特性的特性基因组,并为研究返回匹配的研究提供了工具。序列是以DNASTRING格式输入的,范围作为数据框返回(以AS.DataFrame(Granges)返回的格式)。
作者:杰克·吉斯比[AUT,CRE],Marco Catoni [AUT]
维护者:杰克·吉斯比(Jack Gisby)
引用(从r内,输入引用(“ Packfinder”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:
if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)Biocmanager :: install(“ packfinder”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
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Browsevignettes(“ Packfinder”)
html | R脚本 | 包装 |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 |
版本 | 1.8.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.11(R-4.0)(2年) |
执照 | GPL-2 |
要看 | R(> = 4.0.0) |
进口 | 生物弦,,,,基因组机,,,,kmer,,,,猿, 方法,iranges,,,,S4VECTORS |
链接 | |
建议 | 生物剂,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,测试,,,,Dendextend,,,,生物浏览,,,,生物检查,,,,生物使用 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | https://github.com/jackgisby/packfinder |
BugReports | https://github.com/jackgisby/packfinder/issues |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | packfinder_1.8.0.tar.gz |
Windows二进制 | packfinder_1.8.0.zip(仅64位) |
MacOS 10.13(高山脉) | packfinder_1.8.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/packfinder |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/packfinder |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/packfinder/ |
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