包装

doi:10.18129/b9.bioc.packfinder

包装型转座元件的从头注释

生物导体版本:版本(3.15)

算法和用于硅包装型转座子的工具。过滤一个给定的DNA转座子特性的特性基因组,并为研究返回匹配的研究提供了工具。序列是以DNASTRING格式输入的,范围作为数据框返回(以AS.DataFrame(Granges)返回的格式)。

作者:杰克·吉斯比[AUT,CRE],Marco Catoni [AUT]

维护者:杰克·吉斯比(Jack Gisby)

引用(从r内,输入引用(“ Packfinder”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)Biocmanager :: install(“ packfinder”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ Packfinder”)

html R脚本 包装
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文本 消息

细节

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版本 1.8.0
在生物导体中 Bioc 3.11(R-4.0)(2年)
执照 GPL-2
要看 R(> = 4.0.0)
进口 生物弦,,,,基因组机,,,,kmer,,,,, 方法,iranges,,,,S4VECTORS
链接
建议 生物剂,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,测试,,,,Dendextend,,,,生物浏览,,,,生物检查,,,,生物使用
系统要求
增强
URL https://github.com/jackgisby/packfinder
BugReports https://github.com/jackgisby/packfinder/issues
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 packfinder_1.8.0.tar.gz
Windows二进制 packfinder_1.8.0.zip(仅64位)
MacOS 10.13(高山脉) packfinder_1.8.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/packfinder
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/packfinder
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/packfinder/
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