opencyto

doi:10.18129/b9.bioc.opencyto

流式细胞仪数据的分层门控管道

生物导体版本:版本(3.15)

该软件包旨在以顺序的方式促进自动门控方法,以模仿手动门通策略。

作者:Mike Jiang,John Ramey,Greg Finak,Raphael Gottardo

维护者:Mike Jiang ,Jake Wagner

引用(从r内,输入引用(“ opencyto”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ opencyto”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ opencyto”)

html R脚本 OpencyTo软件包的简介
html R脚本 如何使用不同的自动门控功能
html R脚本 如何编写CSV板模板
PDF 参考手册
文本 消息
文本 执照

细节

生物浏览 bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载
版本 2.8.0
在生物导体中 Bioc 2.13(R-3.0)(8。5年)
执照 文件执照
要看 R(> = 3.5.0)
进口 方法,生物酶,,,,生物基因,,,,gtools,,,,流核(> = 1.99.17),Flowviz,,,,ncdfflow(> = 2.11.34),FlowWorkspace(> = 3.99.1),FlowStats(> = 3.99.1),flowclust(> = 3.11.4),大量的,,,,线索,,,,plyr,,,,rbgl,,,,图形,,,,Data.Table,,,,KS,,,,rcolorbrewer,,,,格子,,,,rrcov,,,,r.utils
链接 RCPP
建议 FlowWorkspacedata,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,降价,,,,测试,utils,工具,并行,ggcyto,,,,细胞瘤
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我 细胞瘤
建议我 催化剂,,,,flowclust,,,,流核,,,,FlowStats,,,,流动时间,,,,FlowWorkspace,,,,ggcyto
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 opencyto_2.8.0.tar.gz
Windows二进制 opencyto_2.8.0.zip(仅64位)
MacOS 10.13(高山脉) opencyto_2.8.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/opencyto
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/opencyto
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/opencyto//
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