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omicRexposome
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DOI:10.18129 / B9.bioc.omicRexposome
暴露组和组学数据关联和集成分析
Bioconductor版本:发行版(3.16)
omicRexposome将暴露数据和omic数据之间的关联评估系统化，利用MultiDataSet进行协调数据管理，利用rexposome进行暴露数据定义，利用limma进行关联测试。还可以使用多重共本分析(omicade4)和多典型相关分析(PMA)进行数据集成，混合暴露数据和组态数据。
作者:Carles Hernandez-Ferrer [aut, cre]， Juan R. González [aut]
维护者:Xavier Escribà Montagut
引文(从R内，输入引用(“omicRexposome”))：
安装
要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:
如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("omicRexposome")
对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．
文档
要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:
browseVignettes(“omicRexposome”)
| 超文本标记语言 | R脚本 | 与Omic数据集成的暴露数据 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 许可证 |
细节
| biocViews | bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 |
| 版本 | 1.20.0 |
| 在Bioconductor | BioC 3.6 (R-3.4)(5年) |
| 许可证 | MIT +文件许可证 |
| 取决于 | R (>= 3.5.0)，Biobase |
| 进口 | 统计，utils, grDevices，图形，方法，rexposome，limma，股东价值分析，ggplot2，ggrepel，PMA，omicade4，gridExtra，MultiDataSet，SmartSVA，isva平行,SummarizedExperiment，stringr |
| 链接 | |
| 建议 | BiocStyle，knitr，rmarkdown，snpStats，brgedata |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 全靠我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
| 源包 | omicRexposome_1.20.0.tar.gz |
| Windows二进制 | omicRexposome_1.20.0.zip |
| macOS二进制文件(x86_64) | omicRexposome_1.20.0.tgz |
| macOS二进制文件(arm64) | omicRexposome_1.20.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/omicRexposome |
| 源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/omicRexposome |
| 生物包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/omicRexposome/ |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/omicRexposome/ |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |
| BioC 3.16的旧源包 | 源存档 |
