oligo.

DOI：10.18129 / b9.bioc.oligo.

用于寡核苷酸阵列的预处理工具

生物导体版本:发布(3.12)

在探针水平下分析寡核苷酸阵列（表达/ SNP / TILINE /外显子）的包装。它目前支持Affymetrix（CEL文件）和Nimblegen阵列（XYS文件）。

作者：奔雪尔顿库尔饭店和拉斐尔伊顿

维护者：Benilton Carvalho <尼苏尔顿在Unicamp.Br>

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细节

biocViews	bob 体育平台下载 那bob 体育平台下载 那bob 体育平台下载 那bob 体育平台下载 那bob 体育平台下载 那bob 体育平台下载 那bob 体育平台下载 那bob 体育平台下载 那bob 体育平台下载 那bob 体育平台下载
版本	1.54.1.
在生物导体中以来	BIOC 2.0（R-2.5）（14岁）
执照	LGPL (> = 2)
依靠	r（> = 3.2.0），生物根系（> = 0.13.11），oligoClasses（> = 1.29.6），BioBase.（> = 2.27.3），Biostrings（> = 2.35.12）
进口	affyio（> = 1.35.0），affxparser(> = 1.39.4),DBI（> = 0.3.1），FF.、图形的方法,预处理核（> = 1.29.0），rsqlite.（> = 1.0.0），样条曲线，统计数据，stats4，utils，zlibbioc
链接到	预处理核
建议	bsgenome.hsapiens.ucsc.hg18那hapmap100kxba.那pd.hg.u95av2.那pd.mapping50k.xba240那pd.huex.1.0.st.v2那pd.hg18.60mer.expr那pd.hugene.1.0.st.v1那maqcexpression4plex那Genefilter.那林马那rcolorbrewer.那oligodata.那生物焦那kn那运行那生物雕那annotationdbi.那acme.那rcurl.
系统要求
加强	domc.那dompi.
URL.
取决于我	斜斜体那牧师那oligodata.那pd.081229.hg18.promoter.medip.hx1那pd.2006.07.18.hg18.refseq.promoter.那pd.2006.07.18.mm8.refseq.promoter.那pd.2006.10.31.rn34.refseq.promoter.那pd.ag.那pd.aragene.1.0.st.那pd.aragene.1.1.st.st.那pd.atdschip.tiling那pd.ath1.121501.那pd.barley1那pd.bovgene.1.0.st.st.那pd.bovgene.1.1.st那Pd.bovine.那pd.bsubtilis.那pd.cangene.1.0.st那pd.cangeene.1.1.st.st.那Pd.Canine.那pd.canine.2那pd.celegans.那pd.charm.hg18.example.那pd.chicken.那pd.chigene.1.0.st那pd.chigene.1.1.st那pd.chogene.2.0.st.那pd.chogene.2.1.st那Pd.Citrus.那pd.clariom.d.human那pd.clariom.s.human那pd.clariom.s.human.ht.那pd.clariom.s.mouse.那pd.clariom.s.mouse.ht.那pd.clariom.s.rat.那pd.clariom.s.rat.ht.那PD.COTTON.那pd.cyngene.1.0.st.st.那pd.cyngene.1.1.st.st.那Pd.cygene.1.0.st.那Pd.cygene.1.1.st.st.那pd.cytogenetics.Array.那pd.drogene.1.0.st那pd.drogene.1.1.st.st.那pd.drosgenome1.那pd.drosophila.2那pd.e.coli.2那pd.ecoli.那pd.ecoli.asv2.那pd.elegene.1.0.st那pd.elegene.1.1.st.st.st.那pd.equgene.1.0.st.st.那pd.equgene.1.1.st.st.那pd.feinberg.hg18.me.hx1.那pd.feinberg.mm8.me.hx1.那pd.felgene.1.0.st.那pd.felgene.1.1.st.st.st.那Pd.fingene.1.0.st.st.那pd.fingene.1.1.1.st.st.那pd.genomewidesnp.5.那pd.genomewidesnp.6.那pd.guigene.1.0.st.那pd.guigene.1.1.st.st.那pd.hc.g110那pd.hg.focus.那pd.hg.u133.plus.2那pd.hg.u133a.那pd.hg.u133a.2那pd.hg.u133a.tag.那pd.hg.u133b.那pd.hg.u219那pd.hg.u95a.那pd.hg.u95av2.那pd.hg.u95b.那pd.hg.u95c.那pd.hg.u95d.那pd.hg.u95e.那pd.hg18.60mer.expr那pd.ht.hg.u133.plus.pm.那pd.ht.hg.u133a那pd.ht.mg.430a那pd.hta.2.0.那pd.hu6800.那pd.huex.1.0.st.v2那pd.hugene.1.0.st.v1那pd.hugene.1.1.st.v1那pd.hugene.2.0.st.那pd.hugene.2.1.st.st.那pd.maize那pd.mapping250k.nsp.nsp.那pd.mapping250k.sty那pd.mapping50k.hind240那pd.mapping50k.xba240那pd.margene.1.0.st.st.那pd.margene.1.1.st.st.那Pd.Medgene.1.0.st.那Pd.Medgene.1.1.st.st.那Pd.Medicago.那pd.mg.u74a那pd.mg.u74av2那pd.mg.u74b那pd.mg.u74bv2.那pd.mg.u74c那pd.mg.u74cv2.那pd.mirna.1.0那pd.mirna.2.0那pd.mirna.3.0.那pd.mirna.3.1.那pd.mirna.4.0.那pd.moe430a那pd.moe430b.那pd.moex.1.0.st.v1那pd.mogene.1.0.st.v1那pd.mogene.1.1.st.v1那pd.mogene.2.0.st.那pd.mogene.2.1.st那pd.mouse430.2那pd.mouse430a.2那pd.mta.1.0那pd.mu11ksuba那pd.mu11ksubb那pd.nugo.hs1a520180那pd.nugo.mm1a520177那pd.ovigene.1.0.st那pd.ovigene.1.1.st那pd.pae.g1a那pd.plasmodium.anopheles那pd.poplar.那pd.portcine.那pd.porgene.1.0.st那Pd.porgene.1.1.st.st.那pd.rabgene.1.0.st那pd.rabgene.1.1.st那pd.rae230a.那pd.rae230b.那pd.raex.1.0.st.v1.那pd.ragene.1.0.st.v1那pd.ragene.1.1.st.v1那pd.ragene.2.0.st那pd.ragene.2.1.st那pd.rat230.2那pd.rcngene.1.0.st.st.那pd.rcngene.1.1.st.st.st.那pd.rg.u34a那pd.rg.u34b那pd.rg.u34c那pd.rhegene.1.0.st那pd.rhegene.1.1.st.st.那pd.rhesus那pd.rice.那pd.rjpgene.1.0.st.st.那pd.rjpgene.1.1.st那pd.rn.u34那pd.rta.1.0.那pd.rusgene.1.0.st.st.那pd.rusgene.1.1.st.st.那pd.s.aureus.那pd.soybean那Pd.soygene.1.0.st.st.那pd.soygene.1.1.st那pd.sugar.cane.那pd.tomato.那pd.u133.x3p.那pd.vitis.vinifera.那pd.wheat那pd.x.laevis.2那pd.x.tropicalis.那pd.xenopus.laevis.那pd.yest.2.那pd.yg.s98那pd.zebgene.1.0.st.st.那pd.zebgene.1.1.st那pd.czebrafish.那pdinfobuilder.那彪马那PumaData.那扫描。通用产品
进口我	ArrayExpress那cn.farms.那Crossmeta.那frma.那斜斜体那mimager.
建议我	fastseg那frmaTools那hapmap100khind那hapmap100kxba.那hapmap500knsp那hapmap500ksty.那hapmapsnp5.那hapmapsnp6.那maqcexpression4plex
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源包	oligo_1.54.1.tar.gz.
Windows二进制文件	oligo_1.54.1.zip
Macos 10.13（高塞拉）	oligo_1.54.1.tgz.
源存储库	git clone https://git.biocumon.org/packages/Oligo.
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.biocondudard.org：包装/ oligo
包短网址	https://biocumon.org/packages/Oligo/
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