NORMR

doi:10.18129/b9.bioc.normr

chip-seq数据中的归一化和差异

生物导体版本:版本(3.15)

CHIP-seq和Chip-selike数据的强大归一化和差异调用程序。读数与用户指定数量的组件共同建模为二项式混合模型。合适的背景估算了某些地区富集的影响,因此代表了一个适当的零假设。这种健壮的背景用于识别显着丰富或耗尽的区域。

作者:Johannes Helmuth [AUT,CRE],Ho-Ryun Chung [aut]

维护者:Johannes Helmuth

引用(从r内,输入引用(“ normr”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)Biocmanager :: install(“ normr”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ normr”)

html R脚本 Normr包装简介
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载
版本 1.22.0
在生物导体中 Bioc 3.4(R-3.3)(5。5年)
执照 GPL-2
要看 r(> = 3.3.0)
进口 方法,统计,utils,grdevices,并行,GenomeInfodB,,,,基因组机,,,,iranges,,,,RCPP(> = 0.11),QVALUE(> = 2.2),bamsignals(> = 1.4),rtracklayer(> = 1.32)
链接 RCPP
建议 生物使用,,,,测试(> = 1.0),尼特,,,,rmarkDown
系统要求 C ++ 11
增强 生物比较
URL https://github.com/your-highness/normr
BugReports https://github.com/your-highness/normr/issues
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 normr_1.22.0.tar.gz
Windows二进制 normr_1.22.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) normr_1.22.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/normr
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/normr
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/normr/
软件包下载报告 下载统计

文档»

生物导体

r/克兰软件包和文档

支持»

请阅读发布指南。向以下位置之一发布有关生物导体的问题:

  • 支持网站- 有关生物处理套件的问题
  • 正常词 邮件列表 - 包装开发人员bob电竞体育官网