NGSReports
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doi：10.18129/b9.bioc.ngsreports
加载FASTQQC报告和其他NGS相关文件
生物导体版本：版本（3.15）
该软件包提供了将FASTQC报告和输出摘要从其他NGS工具中解析为R的方法和对象类，以及解析文件，已实施多个绘图方法来可视化解析数据。图可以作为静态GGPLOT对象或交互式绘图对象生成。
作者：史蒂夫·佩德森[AUT，CRE]，克里斯托弗·沃德[aut]，thu-hien [aut]
维护者：史蒂夫·佩德森（Steve Pederson）
引用（从r内，输入引用（“ ngsreports”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：
if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）Biocmanager :: install（“ ngsreports”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
Browsevignettes（“ NGSReports”）
| html | R脚本 | NGSReports的简介 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 | |
| 文本 | 执照 |
细节
| 生物浏览 | bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 |
| 版本 | 1.12.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.9（R-3.6）（3年） |
| 执照 | 文件执照 |
| 要看 | r（> = 4.1.0），生物基因，，，，GGPLOT2（> = 3.3.5），蒂布尔（> = 1.3.1） |
| 进口 | 生物弦，，，，检查员，，，，dplyr（> = 1.0.0），DT，，，，福卡，，，，ggdendro，grdevices（> = 3.6.0），网格，生命周期，，，，橄榄酸， 方法，潘德，，，，情节（> = 4.9.4），readr，，，，RESHAPE2，，，，rmarkDown，，，，秤，统计Stringr，，，，花花公子，，，，tidyselect（> = 0.2.3），utils，动物园 |
| 链接 | |
| 建议 | 生物使用，，，，开罗，，，，尼特，，，，测试，，，，truncnorm |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | https://github.com/steveped/ngsreports |
| BugReports | https://github.com/steveped/ngsreports/issues |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | ngsreports_1.12.0.tar.gz |
| Windows二进制 | ngsreports_1.12.0.zip |
| MacOS 10.13（高山脉） | ngsreports_1.12.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ngsreports |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/ngsreports |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/ngsreports/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
