nethet

doi:10.18129/b9.bioc.nethet

用于生物网络异质性高维探索的生物通用套件

生物导体版本:版本(3.15)

软件包Nethet是统计固体方法的实现,可从高维数据中分析网络异质性。它结合了最新的统计创新的几种实现,可用于在异质,高维环境中对网络的估计和比较。特别是,我们为高斯图形模型(差异网络和GGM-GSA; Stadler and Mukherjee,2013,2014)提供正式两样本测试的代码,并提供一种新颖的基于网络的聚类算法(混合图形Lasso,Stadler和Mukherjee和Mukherjee,2013年)。

作者:Nicolas Staedler,Frank Dondelinger

维护人员:nicolas staedler ,弗兰克·唐德林格(Frank Dondelinger)

引用(从r内,输入引用(“ nethet”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)Biocmanager :: install(“ nethet”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ nethet”)

PDF R脚本 nethet
PDF 参考手册
文本 消息

细节

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版本 1.28.0
在生物导体中 Bioc 3.1(R-3.2)(7年)
执照 GPL-2
要看
进口 玻璃,,,,mvtnorm,,,,Genenet,,,,巨大的,,,,组合,,,,GGM,,,,mclust, 平行,GSA,,,,林玛,,,,多检验,,,,ICSNP,,,,Glmnet,,,,网络,,,,GGPLOT2,grdevices,图形,统计,utils
链接
建议 尼特,,,,Xtable,,,,生物使用,,,,测试
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源包 nethet_1.28.0.tar.gz
Windows二进制 nethet_1.28.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) nethet_1.28.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/nethet
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/nethet
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/nethet/
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