Netboxr
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doi：10.18129/b9.bioc.netboxr
Netboxr
生物导体版本：版本（3.15）
Netbox是一种基于网络的方法，将先验知识与网络聚类算法相结合。该算法允许识别功能模块，并允许组合多种数据类型，例如突变和拷贝数更改。Netbox对人类相互作用网络进行网络分析，并在四个文献策划的数据源中衍生出的人类相互作用网络（HIN），包括人类蛋白质参考数据库（HPRD），Reactome，NCI-NATURE途径相互作用（PID）数据库和MSKCC癌细胞图。
作者：Eric Minwei Liu [AUT，CRE]，Augustin Luna [AUT]，Ethan Cerami [AUT]，Chris Sander [AUT]
维护者：eirc minwei liu
引用（从r内，输入引用（“ netboxr”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：
if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）Biocmanager :: install（“ NetBoxr”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
browsevignettes（“ netboxr”）
| html | R脚本 | Netboxr教程 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 | |
| 文本 | 执照 |
细节
| 生物浏览 | bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 |
| 版本 | 1.7.1 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.11（R-4.0）（2年） |
| 执照 | LGPL-3 +文件执照 |
| 要看 | r（> = 4.0.0），Igraph（> = 1.2.4.1），并行 |
| 进口 | rcolorbrewer，，，，DT，统计clusterProfiler，，，，Data.Table，，，，GPLOTS，，，，jsonlite，，，，plyr |
| 链接 | |
| 建议 | Paxtoolsr，，，，生物使用，，，，org.hs.eg.db，，，，尼特，，，，rmarkDown，，，，测试，CGDSR |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | NetBoxr_1.7.1.tar.gz |
| Windows二进制 | netboxr_1.7.1.zip |
| MacOS 10.13（高山脉） | NetboxR_1.7.1.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/netboxr |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/netboxr |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/netboxr/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
