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nempi
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DOI:10.18129 / B9.bioc.nempi
从基因表达数据推断未观察到的扰动
Bioconductor版本:发行版(3.16)
将不完全扰动剖面和对数概率的差异基因表达作为输入，并推断未观察到的扰动并增加已观察到的扰动。通过迭代地从扰动中推断出一个网络，并从网络中推断出扰动来完成推理。网络推理由嵌套效应模型完成。
作者:Martin Pirkl [aut, cre]
维护者:Martin Pirkl
引文(从R内，输入引用(“nempi”))：
安装
要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:
如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．
文档
要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:
browseVignettes(“nempi”)
| 超文本标记语言 | R脚本 | nempi |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 |
| 版本 | 1.6.0 |
| 在Bioconductor | BioC 3.13 (R-4.1)(1.5年) |
| 许可证 | GPL-3 |
| 取决于 | R (>= 4.1)，mnem |
| 进口 | e1071，nnet，randomForest，naturalsort，图形，统计，utils，matrixStats，epiNEM |
| 链接 | |
| 建议 | knitr，BiocGenerics，rmarkdown，RUnit |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | https://github.com/cbg-ethz/nempi/ |
| BugReports | https://github.com/cbg-ethz/nempi/issues |
| 全靠我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
| 源包 | nempi_1.6.0.tar.gz |
| Windows二进制 | nempi_1.6.0.zip |
| macOS二进制文件(x86_64) | nempi_1.6.0.tgz |
| macOS二进制文件(arm64) | nempi_1.6.0.tgz |
| 源库 | Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/nempi |
| 源存储库(开发人员访问) | Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/nempi |
| 生物包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/nempi/ |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/nempi/ |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |
