ndexr

DOI:10.18129 / B9.bioc.ndexr

NDEx R客户端库

Bioconductor版本:版本(3.17)

这个包提供了一个接口NDEx服务器,如公共服务器http://ndexbio.org/。它可以通过API检索和保存网络。网络是提供作为RCX对象和igraph表示。

作者:Florian奥尔(cre, aut)弗兰克·克莱默(施),亚历克斯Ishkin[所有],德克斯特普拉特(施)

维护人员:Florian奥尔<弗洛里安。奥氏小体在informatik.uni-augsburg.de >

从内部引用(R,回车引用(“ndexr”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“ndexr”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“ndexr”)

HTML R脚本 NDExR装饰图案
PDF 参考手册
文本 新闻
文本 许可证

细节

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版本 1.22.0
Bioconductor自 BioC 3.6 (r - 3.4)(5.5年)
许可证 BSD_3_clause +文件许可证
取决于 RCX
进口 httr、jsonlite plyr tidyr
链接
建议 BiocStyle,knitr testthat rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL https://github.com/frankkramer-lab/ndexr
BugReports https://github.com/frankkramer-lab/ndexr/issues
取决于我
进口我
建议我 netgsa
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 ndexr_1.22.0.tar.gz
Windows二进制 ndexr_1.22.0.zip(64位)
macOS二进制(x86_64) ndexr_1.22.0.tgz
macOS二进制(arm64) ndexr_1.22.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ndexr
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ ndexr
Bioc包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/ndexr/
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/ndexr/
包下载报告 下载数据

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