mzID

DOI:10.18129 / B9.bioc.mzID

R的mzIdentML解析器

Bioconductor版本:发行版(3.13)

使用XML包实现的mzIdentML文件解析器。解析器试图通用,能够处理所有类型的mzIdentML文件,缺点是与特定于供应商的解析器相比输出更“漂亮”。请联系维护人员与任何问题,并提供一个mzIdentML文件,以便问题可以快速修复。

作者:Laurent Gatto,托马斯·佩德森[au], Vladislav Petyuk [ctb]

维护者:Laurent Gatto < Laurent。与在uclouvain.be >

引用(从R中,输入引用(“mzID”)):

安装

要安装此包,启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("mzID")

对于较老版本的R,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:

browseVignettes(“mzID”)

PDF R脚本 使用mzID
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文本 新闻

细节

biocViews bob 体育平台下载 bob 体育平台下载 bob 体育平台下载 bob 体育平台下载 bob 体育平台下载
版本 1.30.0
Bioconductor自 BioC 2.13 (R-3.0)(7.5年)
许可证 GPL (> = 2)
取决于 方法
进口 XMLplyr平行,doParallelforeach迭代器ProtGenerics
链接
建议 knitrtestthat
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我 蛋白质组学
进口我 MSGFguiMSGFplusMSnbaseMSnID
建议我 mzRRforProteomics
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

源包 mzID_1.30.0.tar.gz
Windows二进制 mzID_1.30.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra) mzID_1.30.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/mzID
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ mzID
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/mzID/
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