Bioconductor版本:Release (3.15)
基于非参数自举和排列重采样的多重测试程序(包括经验贝叶斯方法),用于控制全族错误率(FWER)、广义全族错误率(gwer)、假阳性比例的尾概率(TPPFP)和假发现率(FDR)。实现了基于引导的空分布的几种选择(居中、居中和缩放、分位数转换)。可以使用单步方法和分步方法。包括基于各种t-和f -统计量(包括基于线性和生存模型回归参数的t-统计量以及基于相关参数的t-统计量)的检验。当用t-统计量探测假设时,用户也可以选择一个可能更快的零分布,它是均值为零的多元正态分布,方差协方差矩阵来自向量影响函数。结果以调整后的p值、置信区域和检验统计量截断来报告。该方法可直接应用于DNA微阵列实验中差异表达基因的鉴定。
作者:Katherine S. Pollard, Houston N. Gilbert, Yongchao Ge, Sandra Taylor, Sandrine Dudoit
维护者:Katherine S. Pollard < Katherine。Pollard在gladstone.ucsf.edu>
引文(从R内,输入引用(“相乘”)
):
要安装这个包,启动R(版本“4.2”)并输入:
如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
参考手册 |
biocViews | bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 |
版本 | 2.52.0 |
在Bioconductor | BioC 1.6 (R-2.1)或更早(> 17.5年) |
许可证 | LGPL |
取决于 | R(>= 2.10),方法,BiocGenerics,Biobase |
进口 | 生存,质量, stats4 |
链接 | |
建议 | 雪 |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | aCGH,BicARE,iPAC,KCsmart,PREDA,雨,REDseq,siggenes,webbioc |
进口我 | a4Base,ABarray,adSplit,ALDEx2,anota,anota2seq,ChIPpeakAnno,IsoGeneGUI,mAPKL,metabomxtr,microbiomeMarker,nethet,OCplus,phyloseq,RTopper,SingleCellSignalR,singleCellTK,synapter,webbioc |
建议我 | annaffy,ecolitk,factDesign,GOstats,GSEAlm,maigesPack,ropls,topGO,xcms |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | multtest_2.52.0.tar.gz |
Windows二进制 | multtest_2.52.0.zip(64位) |
macOS 10.13 (High Sierra) | multtest_2.52.0.tgz |
源库 | Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/multtest |
源存储库(开发人员访问) | Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/multtest |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/multtest/ |
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