Multicrispr
 |
 |
 |
 |
 |
 |
 |
doi：10.18129/b9.bioc.multicrispr
多洛克斯多功能CRISPR/CAS Design
生物导体版本：版本（3.15）
该软件包用于设计CRISPR/CAS9和主要编辑实验。它包含（1）定义和转换基因组靶标的功能，（2）查找垫片（4）计数Offtarget（MIS）匹配项，并且（5）计算DOENCH2016/2014目标靶向效率。已注意MulticRispr可以很好地扩展到大型目标集，从而实现了大型CRISPR/CAS9库的设计。
作者：Aditya Bhagwat [AUT，CRE]，Rene Wiegandt [CTB]，Mette Bentsen [CTB]，Jens Preussner [CTB]，Michael Lawrence [CTB]，HervéPagès，Johannes Graumannes Graumann [Sad]，Mario Looso [Mario Looso [Mario Looso]，rth]
维护者：aditya bhagwat
引用（从r内，输入引用（“ Multicrispr”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：
if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）Biocmanager :: install（“ MultiCrispr”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
Browsevignettes（“ MultiCrispr”）
| html | R脚本 | Genome_arithmetics |
| html | R脚本 | grna_design |
| html | R脚本 | Prime_editing |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 |
| 版本 | 1.6.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.12（R-4.0）（1。5年） |
| 执照 | GPL-2 |
| 要看 | R（> = 4.0） |
| 进口 | 断言的，，，，生物基因，，，，生物弦，，，，BSGENOME，，，，CRISPRSEEK，，，，Data.Table，，，，GenomeInfodB，，，，GenomicFeatures，，，，基因组机，，，，GGPLOT2， 网格，核粒子，，，，马格里特，方法，并行，plyranges，，，，rbowtie，，，，网状，，，，rtracklayer，统计Stringi，，，，花花公子，，，，tidyselect，UTILS |
| 链接 | |
| 建议 | AnnotationHub，，，，生物使用，，，，bsgenome.hsapiens.ucsc.hg38，，，，bsgenome.mmusculus.ucsc.mm10，，，，BSGENOME.SCEREVISIAE.UCSC.SACCER1，，，，Ensembldb，，，，iranges，，，，尼特，，，，魔术，，，，rmarkDown，，，，测试，，，，txdb.mmusculus.ucsc.mm10.nowngene |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | https://github.com/loosolab/multicrispr |
| BugReports | https://github.com/loosolab/multicrispr/issues |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | MULTICRISPR_1.6.0.TAR.GZ |
| Windows二进制 | MULTICRISPR_1.6.0.ZIP |
| MacOS 10.13（高山脉） | MULTICRISPR_1.6.0.TGZ |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/multicrispr |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/multicrispr |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/multicrispr/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
