生物导体版本:版本(3.13)
可以在转录组,蛋白质组学和/或代谢组水平上使用从8个不同数据库(KEGG,Reactome,Biocarta等)得出的途径提取的特征来计算基于GSEA的组合富集评分。
作者:Sebastian Canzler [AUT,CRE],JörgHackermüller[aut]
维护者:塞巴斯蒂安·坎兹勒(Sebastian Canzler)<塞巴斯蒂安(Sebastian)。
引用(从r内,输入引用(“ Multigsea”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.1”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ multigsea”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“ Multigsea”)
html | R脚本 | Multigsea.html |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 |
版本 | 1.2.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.12(R-4.0)(0.5岁) |
执照 | GPL-3 |
要看 | R(> = 4.0.0) |
进口 | 马格里特,,,,石墨,,,,AnnotationDbi,,,,dplyr,,,,fgsea,,,,代码,,,,Rappdirs,,,,rlang, 方法 |
链接 | |
建议 | org.hs.eg.db,,,,org.mm.eg.db,,,,org.rn.eg.db,,,,org.ss.eg.db,,,,org.bt.eg.db,,,,org.ce.eg.db,,,,org.dm.eg.db,,,,org.dr.eg.db,,,,org.gg.eg.db,,,,org.xl.eg.db,,,,org.cf.eg.db,,,,代谢物图,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,生物使用,,,,测试(> = 2.1.0) |
系统要求 | |
增强 | |
URL | https://github.com/yigbt/multigsea |
BugReports | https://github.com/yigbt/multigsea/issues |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | Multigsea_1.2.0.tar.gz |
Windows二进制 | multigsea_1.2.0.zip(32-和64位) |
MacOS 10.13(高山脉) | Multigsea_1.2.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/multigsea |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/multigsea |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/multigsea/ |
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