多阵风

DOI：10.18129 / b9.bioc.mucticlust.

多阵挛性：用于识别癌症转录组谱中生物相关簇的R包

Biocometiond版本：释放（3.12）

进行聚类以识别转录组科曲线中的模式，以确定患者的临床相关亚组。特征（基因）选择是该过程的关键和组成部分。目前，有许多特征选择和聚类方法来识别相关基因并执行样本的聚类。然而，选择合适的方法是困难的。此外，可用包不支持广泛的特征选择方法。因此，我们开发了一种称为多阵列的一体化R包，使研究人员能够在轻松选择基因选择和聚类方法的选择。使用多阵击，我们在临床结果的背景下识别了最佳性能的聚类方法。我们的观察结果表明，诸如基于方差的排名等简单的方法对大多数数据集表现良好，只要选择适当数量的基因。然而，不同的基因排名和选择方法仍然与所有研究的方法无关。

作者：Nathan Lawlor [Aut，Cre]，Peiyong Guan [Aut]，Alec Fabbri [Aut]，Krish Karuturi [Aut]，Joshy George [Aut]

维护者：Nathan Lawlor

安装

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if（！percennamespace（“biocmanager”，静静= true））install.packages（“biocmanager”）biocmanager ::安装（“multiclust”）

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HTML.	r script.	多阵风指南
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细节

Biocviews.	bob 体育平台下载 那bob 体育平台下载 那bob 体育平台下载 那bob 体育平台下载 那bob 体育平台下载
版本	1.20.0
在生物导体中以来	BIOC 3.3（R-3.3）（5年）
执照	GPL（> = 2）
依靠
进口	蒙链那CTC.那生存那簇那dendextend.那一张地图，图形，grdevices
链接到
建议	kn那贡献那运行那生物根系那预处理核那BioBase.那地理曲线
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包档案包

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源包	multiciclust_1.20.0.tar.gz.
Windows二进制文件	multiciclust_1.20.0.zip.
Macos 10.13（高塞拉）	multiciclust_1.20.0.tgz.
源存储库	git clone https://git.biocumon.org/packages/multiclust.
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.biocondion.org：包/多阵列
包短网址	https://biocumon.org/packages/multiclust/
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