msmstests
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doi：10.18129/b9.bioc.msmstests
LC-MS/MS差分表达测试
生物导体版本：版本（3.15）
通过光谱计数对无标记的LC-MS/MS数据进行统计测试，以发现两种生物条件之间差异表达的蛋白质。提供了三个测试：泊松GLM回归，准类GLM回归和EDGER软件包的负二项式。这三个模型接纳了控制损坏变量的阻止因子。确保可重复性的良好水平可用性检验过滤器可用，我们可能会设置最小效应大小认为是生物学相关的，以及最丰富的条件的最小表达。
作者：Josep Gregori，Alex Sanchez和Josep Villanueva
维护者：josep gregori i font
引用（从r内，输入引用（“ msmstests”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：
if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）Biocmanager :: install（“ msmstests”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
browsevignettes（“ msmstests”）
| R脚本 | MSMSTEST：通过阻塞来控制批处理效果 | |
| R脚本 | MSMSTests：后测试过滤器以提高可重复性 | |
| 参考手册 |
细节
| 生物浏览 | bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 |
| 版本 | 1.34.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 2.13（R-3.0）（9年） |
| 执照 | GPL-2 |
| 要看 | r（> = 3.0.1），MSNBase，，，，MSMSEDA |
| 进口 | EDGER，，，，QVALUE |
| 链接 | |
| 建议 | |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | MSNID |
| 建议我 | rforpoteomics |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | msmstests_1.34.0.tar.gz |
| Windows二进制 | msmstests_1.34.0.zip |
| MacOS 10.13（高山脉） | msmstests_1.34.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/msmstests |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/msmstests |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/msmstests/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
