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msgbsR
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DOI:10.18129 / B9.bioc.msgbsR
msgbsR:甲基化敏感基因分型测序(MS-GBS) R功能
生物导体版本:发布(3.13)
用于MS-GBS实验分析的管道。
作者:本杰明·梅恩
维护人员:Benjamin Mayne < Benjamin。梅恩在adelaide.edu.au >
引文(从R中输入引用(“msgbsR”)):
安装
要安装此包，请启动R(版本“4.1”)并输入:
如果(!安装BiocManager::install("msgbsR")
有关较旧版本的R，请参阅适当的Bioconductor释放。
文档
要查看系统中安装的软件包版本的文档，请启动R并输入:
browseVignettes(“msgbsR”)
| R脚本 | msgbsR_Example | |
| 参考手册 |
细节
| biocViews | bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 |
| 版本 | 1.16.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.5 (R-3.4)(4年) |
| 许可证 | GPL-2 |
| 取决于 | R (> = 3.4),GenomicRanges、方法 |
| 进口 | BSgenome,easyRNASeq,刨边机,GenomicAlignments,GenomicFeatures,GenomeInfoDb,ggbio,ggplot2,IRanges平行,plyr,Rsamtools,R.utils统计数据,SummarizedExperiment,S4Vectors,跑龙套 |
| 链接 | |
| 建议 | roxygen2,BSgenome.Rnorvegicus.UCSC.rn6 |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。
| 源包 | msgbsR_1.16.0.tar.gz |
| Windows二进制 | msgbsR_1.16.0.zip |
| macOS 10.13 (High Sierra) | msgbsR_1.16.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/msgbsR |
| 源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ msgbsR |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/msgbsR/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
