MSA
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doi：10.18129/b9.bioc.msa
多序列比对
生物导体版本：版本（3.15）
“ MSA”软件包为多个序列比对算法Clustalw，Clustalomega和Muscle提供了统一的R/生物导体界面。所有三种算法都集成在包装中，因此，它们不依赖任何外部软件工具，并且适用于所有主要平台。多个序列比对算法是通过使用乳胶包装TexShade贴印多个序列比对的函数来补充的。
作者：Enrico Bonatesta，Christoph Horejs-Kainrath，Ulrich Bodenhofer
维护者：ulrich bodenhofer
引用（从r内，输入引用（“ MSA”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：
if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ msa”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
Browsevignettes（“ MSA”）
| R脚本 | MSA-用于多个序列对齐的R软件包 | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 |
| 版本 | 1.28.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.1（R-3.2）（7年） |
| 执照 | GPL（> = 2） |
| 要看 | r（> = 3.3.0），方法，生物弦（> = 2.40.0） |
| 进口 | RCPP（> = 0.11.1），生物基因，，，，iranges（> = 1.20.0），S4VECTORS， 工具 |
| 链接 | RCPP |
| 建议 | 生物酶，，，，尼特，，，，seqinr，，，，猿（> = 5.1），Phangorn |
| 系统要求 | gnu做 |
| 增强 | |
| URL | http://www.bioinf.jku.at/software/msa/ |
| 取决于我 | |
| 进口我 | 淋巴索，，，，odseq，，，，Surfaltr |
| 建议我 | idpr |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | msa_1.28.0.tar.gz |
| Windows二进制 | msa_1.28.0.zip |
| MacOS 10.13（高山脉） | msa_1.28.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/msa |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/msa |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/msa/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
