Biocometiond版本:释放(3.12)
Motifstack封装专为具有不同相似性分数的多个图案的图形表示而设计。它适用于DNA / RNA序列基序和氨基酸序列基序。此外,它还为用户提供了自定义图形参数,例如字体类型和符号颜色的灵活性。
作者:建红欧,迈克尔布罗德斯基,苏格兰沃尔夫和李华朱莉朱
维护者:建红欧<建虹。杜克·德杜>
引文(从R内,输入引文(“MOTIFSTACK”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“4.0”)并输入:
if(!percennamespace(“biocmanager”,squilly = true))install.packages(“biocmanager”)biocmanager ::安装(“motifstack”)
对于旧版本,请参阅相应的生物导体释放。
要查看系统中安装此包版本的文档,请启动r并输入:
BROWSEVIGNETTES(“MOTIFSTACK”)
HTML. | r script. | Motifstack Vignette. |
PDF. | 参考手册 | |
文本 | 消息 |
Biocviews. | bob 体育平台下载 那bob 体育平台下载 那bob 体育平台下载 那bob 体育平台下载 那bob 体育平台下载 那bob 体育平台下载 那bob 体育平台下载 那bob 体育平台下载 那bob 体育平台下载 那bob 体育平台下载 |
版本 | 1.34.0 |
在生物导体中以来 | BIOC 2.11(R-2.15)(8.5岁) |
执照 | GPL(> = 2) |
依靠 | R(> = 2.15.1),方法,网格 |
进口 | ADE4.那生物仪器那ggplot2.,grdevices,图形,HTMLWidgets.,统计数据,stats4,utils,XML. |
链接到 | |
建议 | gr那格里姆波特2.那生物根系那motifdb.那rcolorbrewer.那生物焦那kn |
系统要求 | |
加强 | |
URL. | |
取决于我 | Generegulation. |
进口我 | Atacseqqc.那atsnp.那daglogo.那洛卡马那MotifBreakr.那RibosomeProfiling QC那tcgaworkflow. |
建议我 | Chippeakanno.那tfutils.那uposencymotif |
链接给我 | |
建立报告 |
跟随bob 体育网址 在r会话中使用此包的说明。
源包 | motifstack_1.34.0.tar.gz. |
Windows二进制文件 | motifstack_1.34.0.zip.(32-&64位) |
Macos 10.13(高塞拉) | motifstack_1.34.0.tgz. |
源存储库 | git clone https://git.biocumon.org/packages/motifstack. |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.biocondudard.org:包装/ motifstack |
包短网址 | https://biocumon.org/packages/motifstack/ |
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