Motifstack.

DOI:10.18129 / b9.bioc.motifstack.

绘制单个或多个DNA,RNA和氨基酸序列的堆叠徽标

Biocometiond版本:释放(3.12)

Motifstack封装专为具有不同相似性分数的多个图案的图形表示而设计。它适用于DNA / RNA序列基序和氨基酸序列基序。此外,它还为用户提供了自定义图形参数,例如字体类型和符号颜色的灵活性。

作者:建红欧,迈克尔布罗德斯基,苏格兰沃尔夫和李华朱莉朱

维护者:建红欧<建虹。杜克·德杜>

引文(从R内,输入引文(“MOTIFSTACK”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.0”)并输入:

if(!percennamespace(“biocmanager”,squilly = true))install.packages(“biocmanager”)biocmanager ::安装(“motifstack”)

对于旧版本,请参阅相应的生物导体释放

文件

要查看系统中安装此包版本的文档,请启动r并输入:

BROWSEVIGNETTES(“MOTIFSTACK”)

HTML. r script. Motifstack Vignette.
PDF. 参考手册
文本 消息

细节

Biocviews. bob 体育平台下载 bob 体育平台下载 bob 体育平台下载 bob 体育平台下载 bob 体育平台下载 bob 体育平台下载 bob 体育平台下载 bob 体育平台下载 bob 体育平台下载 bob 体育平台下载
版本 1.34.0
在生物导体中以来 BIOC 2.11(R-2.15)(8.5岁)
执照 GPL(> = 2)
依靠 R(> = 2.15.1),方法,网格
进口 ADE4.生物仪器ggplot2.,grdevices,图形,HTMLWidgets.,统计数据,stats4,utils,XML.
链接到
建议 gr格里姆波特2.生物根系motifdb.rcolorbrewer.生物焦kn
系统要求
加强
URL.
取决于我 Generegulation.
进口我 Atacseqqc.atsnp.daglogo.洛卡马MotifBreakr.RibosomeProfiling QCtcgaworkflow.
建议我 Chippeakanno.tfutils.uposencymotif
链接给我
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包档案包

跟随bob 体育网址 在r会话中使用此包的说明。

源包 motifstack_1.34.0.tar.gz.
Windows二进制文件 motifstack_1.34.0.zip.(32-&64位)
Macos 10.13(高塞拉) motifstack_1.34.0.tgz.
源存储库 git clone https://git.biocumon.org/packages/motifstack.
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.biocondudard.org:包装/ motifstack
包短网址 https://biocumon.org/packages/motifstack/
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支持»

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