马赛克

doi:10.18129/b9.bioc.mosaics

马赛克(基于模型的一个和两个样本分析以及芯片序列的推断)

生物导体版本:版本(3.13)

该软件包提供了拟合马赛克和马赛克hmm的功能,这是一个统计框架,用于分析转录因子结合和组蛋白修饰的单样本或两样本芯片seq数据。

作者:Dongjun Chung,Pei Fen Kuan,Rene Welch,Sunduz Keles

维护者:dongjun chung

引用(从r内,输入引用(“马赛克”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.1”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ Mosaics”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“马赛克”)

PDF R脚本 马赛克
PDF 参考手册
文本 消息

细节

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版本 2.30.0
在生物导体中 Bioc 2.8(R-2.13)(10年)
执照 GPL(> = 2)
要看 R(> = 3.0.0),方法,图形,RCPP
进口 大量的,花键,格子,,,,iranges,,,,基因组机,,,,基因组签名,,,,rsamtools,,,,GenomeInfodB,,,,S4VECTORS
链接 RCPP
建议 mosaicsexample
系统要求 珀尔
增强 平行
URL http://groups.google.com/group/mosaics_user_group
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 Mosaics_2.30.0.tar.gz
Windows二进制 MOSAICS_2.30.0.ZIP
MacOS 10.13(高山脉) Mosaics_2.30.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/mosaics
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:包装/马赛克
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/mosaics/
软件包下载报告 下载统计

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